Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDNFP23560 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDNFP23560 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDNFP23560 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BDNFP23560 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDNFP23560 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms