Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HRCP23327 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HRCP23327 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HRCP23327 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HRCP23327 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HRCP23327 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HRCP23327 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HRCP23327 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HRCP23327 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HRCP23327 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HRCP23327 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HRCP23327 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HRCP23327 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HRCP23327 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HRCP23327 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HRCP23327 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
HRCP23327 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
HRCP23327 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HRCP23327 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms