Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms