Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNA3P22001 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA3P22001 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms