Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP4AP20648 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms