Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL3P19876 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms