Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFE3P19532 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFE3P19532 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFE3P19532 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFE3P19532 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFE3P19532 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms