Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCAM1P19320 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms