Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDCP19113 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDCP19113 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDCP19113 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDCP19113 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDCP19113 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDCP19113 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDCP19113 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDCP19113 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms