Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCC1P18754 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RCC1P18754 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC1P18754 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC1P18754 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC1P18754 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC1P18754 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC1P18754 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms