Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD1P17405 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms