Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMC1P11047 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms