Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2P10911 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2P10911 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2P10911 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2P10911 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2P10911 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2P10911 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2P10911 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2P10911 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2P10911 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2P10911 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2P10911 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2P10911 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2P10911 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms