Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYNX1P0DP58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYNX1P0DP58 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYNX1P0DP58 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYNX1P0DP58 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYNX1P0DP58 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYNX1P0DP58 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNX1P0DP58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNX1P0DP58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNX1P0DP58 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYNX1P0DP58 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms