Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms