Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGA3P0DJD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms