Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP10P09238 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP10P09238 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP10P09238 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP10P09238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP10P09238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP10P09238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP10P09238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP10P09238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP10P09238 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP10P09238 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP10P09238 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP10P09238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP10P09238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP10P09238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP10P09238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms