Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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