Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRCP08575 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRCP08575 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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