Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms