Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms