Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24AO95486 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24AO95486 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms