Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1O95476 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1O95476 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms