Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOBTB3O94955 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms