Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB3O75712 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB3O75712 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB3O75712 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB3O75712 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB3O75712 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB3O75712 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB3O75712 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB3O75712 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms