Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NPM3O75607 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPM3O75607 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPM3O75607 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPM3O75607 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPM3O75607 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPM3O75607 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPM3O75607 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms