Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAMP4O75379 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAMP4O75379 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms