Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CILPO75339 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CILPO75339 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CILPO75339 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CILPO75339 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CILPO75339 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CILPO75339 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CILPO75339 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CILPO75339 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CILPO75339 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CILPO75339 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CILPO75339 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms