Protein–RNA interactions for Protein: O60895

RAMP2, Receptor activity-modifying protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAMP2O60895 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAMP2O60895 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAMP2O60895 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms