Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMFO60524 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMFO60524 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEMFO60524 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEMFO60524 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NEMFO60524 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMFO60524 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMFO60524 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMFO60524 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms