Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOBOXO60393 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOBOXO60393 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOBOXO60393 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOBOXO60393 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOBOXO60393 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms