Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCA5O60264 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms