Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL3O43909 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms