Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR2O43760 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms