Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms