Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASA4O43374 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASA4O43374 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASA4O43374 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RASA4O43374 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASA4O43374 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASA4O43374 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASA4O43374 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASA4O43374 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms