Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2DO15399 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms