Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN3O15232 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MATN3O15232 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MATN3O15232 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MATN3O15232 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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