Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2LO15068 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms