Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms