Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRDCB7Z8K6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms