Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-1B6SEH8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms