Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf51A6NDU8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C5orf51A6NDU8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms