Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms