Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF27A3QJZ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms