Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM89A2RUT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM89A2RUT3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM89A2RUT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM89A2RUT3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM89A2RUT3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms