Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CCNK-204ENST00000555049 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 KIAA1024L-201ENST00000564719 2354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PDE6H-201ENST00000266395 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC22A6-201ENST00000360421 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RALYL-201ENST00000517638 1972 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GPD2-213ENST00000540309 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MBLAC2-201ENST00000316610 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL596223.1-201ENST00000450995 1933 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC018647.2-201ENST00000605778 4200 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MSH3-201ENST00000265081 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MAPK10-361ENST00000641862 2462 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CCNB1IP1-206ENST00000437553 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC010547.5-201ENST00000561908 3677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TIGIT-201ENST00000383671 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC01511-202ENST00000504989 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF473-201ENST00000270617 4688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC11A2-205ENST00000545993 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 C9orf85-206ENST00000486911 3321 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC01718-201ENST00000441660 391 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 Z84723.1-201ENST00000568710 773 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC024568.1-201ENST00000517330 2260 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZFAND4-202ENST00000344646 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HAP1-201ENST00000310778 4087 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AMMECR1-202ENST00000372057 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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