Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL136982.1-201ENST00000444431 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF213-AS1-203ENST00000571963 1592 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 WEE2-AS1-209ENST00000488785 2262 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RCAN1-202ENST00000381132 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TXNL4B-201ENST00000268483 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DGKA-201ENST00000331886 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RASGRP4-204ENST00000454404 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PADI3-201ENST00000375460 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LILRB5-201ENST00000316219 3236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RMI1-201ENST00000325875 3420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CFAP65-202ENST00000341552 5953 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PEX11A-201ENST00000300056 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL035681.1-201ENST00000441316 2500 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EIF1B-AS1-205ENST00000629723 2399 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RASGEF1B-201ENST00000264400 2277 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC110615.1-201ENST00000438151 1955 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DPT-201ENST00000367817 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TMEM52B-201ENST00000298530 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NOD1-201ENST00000222823 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ATL1-201ENST00000358385 2647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ARMT1-201ENST00000367294 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF18-202ENST00000454073 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC116913.1-201ENST00000565387 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BNC2-202ENST00000380667 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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