Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 RIPPLY1-202ENST00000411805 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 HPD-201ENST00000289004 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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