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| PTPRJ | Q12913 | KRTAP12-4-201 | ENST00000391618 | 447 nt | APPRIS P1 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARF1P2-201 | ENST00000392493 | 538 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYTH4-202 | ENST00000402997 | 633 nt | TSL 4 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | APOBEC3B-204 | ENST00000407298 | 1282 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL021407.3-201 | ENST00000407522 | 486 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RIPPLY1-202 | ENST00000411805 | 786 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL445933.2-201 | ENST00000440249 | 265 nt | TSL 2 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PFN1P3-201 | ENST00000443612 | 402 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PFN1P4-201 | ENST00000450970 | 402 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RN7SL743P-201 | ENST00000475032 | 298 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM153C-208 | ENST00000511189 | 926 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEMA6A-AS1-206 | ENST00000514214 | 782 nt | TSL 3 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001922.3-201 | ENST00000524768 | 842 nt | TSL 3 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC22A18AS-202 | ENST00000526203 | 664 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MORF4L1-208 | ENST00000558746 | 874 nt | TSL 3 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SMIM28-201 | ENST00000573100 | 855 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C17orf62-210 | ENST00000577732 | 1053 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC022001.3-201 | ENST00000606330 | 596 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM69A-204 | ENST00000615519 | 865 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BPIFA1-204 | ENST00000618484 | 907 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00869-208 | ENST00000621156 | 737 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC16A1-AS1-207 | ENST00000627431 | 1073 nt | TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HPD-201 | ENST00000289004 | 1419 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OGFR-202 | ENST00000370461 | 4506 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EXOSC9-202 | ENST00000379663 | 1529 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC018861.1-201 | ENST00000518404 | 1614 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELP4-207 | ENST00000638347 | 1651 nt | TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HMGB2-201 | ENST00000296503 | 1889 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NOXRED1-201 | ENST00000380835 | 1857 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CHD5-201 | ENST00000262450 | 9646 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WNT5A-201 | ENST00000264634 | 6176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC055813.1-201 | ENST00000587110 | 2123 nt | BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AGPAT1-206 | ENST00000395499 | 2496 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCDC38-202 | ENST00000546386 | 2599 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GZF1-202 | ENST00000377051 | 4740 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KCNJ10-201 | ENST00000368089 | 5528 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRM1-204 | ENST00000492807 | 6836 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.01 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DNAJC13-201 | ENST00000260818 | 7730 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SUSD6-201 | ENST00000342745 | 5388 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GOLGA1-202 | ENST00000373555 | 4811 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WDR66-201 | ENST00000288912 | 4467 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GALNT14-203 | ENST00000406653 | 2496 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BORCS7-201 | ENST00000339834 | 2422 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NUTM2A-AS1-208 | ENST00000446751 | 2394 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRMT12-201 | ENST00000328599 | 2207 nt | APPRIS P1 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GNL3-202 | ENST00000418458 | 2040 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Z95115.1-201 | ENST00000566814 | 2032 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CTLA4-202 | ENST00000302823 | 1977 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM13C-201 | ENST00000422313 | 1963 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZC3HC1-209 | ENST00000481503 | 1741 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PTPRN2-203 | ENST00000389418 | 4706 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MST1R-215 | ENST00000621387 | 4449 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL355607.2-201 | ENST00000563268 | 1395 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01686-201 | ENST00000566297 | 1376 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR1I2-207 | ENST00000640105 | 1305 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FLT3-201 | ENST00000241453 | 3842 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | REG1B-201 | ENST00000305089 | 767 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IZUMO1R-201 | ENST00000328458 | 798 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VKORC1-203 | ENST00000354895 | 901 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MTND6P9-201 | ENST00000458075 | 519 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNORD10-201 | ENST00000459579 | 142 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C5orf63-203 | ENST00000509733 | 553 nt | TSL 4 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPA1P12-201 | ENST00000515379 | 961 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PSMA3-AS1-208 | ENST00000555275 | 903 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NAT9-204 | ENST00000578822 | 839 nt | TSL 3 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC090236.1-201 | ENST00000590318 | 768 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC025165.4-201 | ENST00000602327 | 433 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | Metazoa_SRP.95-201 | ENST00000619648 | 282 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC006581.2-201 | ENST00000631830 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNS1-205 | ENST00000419504 | 5921 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNS1-207 | ENST00000430930 | 5900 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC005696.4-201 | ENST00000614400 | 3147 nt | BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZMIZ1-202 | ENST00000446377 | 6686 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STAT3-213 | ENST00000588969 | 2772 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SON-203 | ENST00000381679 | 7860 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SUN2-202 | ENST00000405510 | 4055 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ANKRD49-210 | ENST00000544612 | 2268 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HSPA8-201 | ENST00000227378 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF519-206 | ENST00000589498 | 2117 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZDHHC7-201 | ENST00000313732 | 3442 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001469.3-202 | ENST00000430259 | 2014 nt | TSL 5 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MARCH7-209 | ENST00000539065 | 3303 nt | TSL 2 BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FBXO32-203 | ENST00000517956 | 6744 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | USF1-203 | ENST00000368021 | 1807 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DUOX2-201 | ENST00000389039 | 6533 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF630-206 | ENST00000442455 | 2829 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM229B-207 | ENST00000557006 | 3941 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HSPA14-202 | ENST00000437161 | 1689 nt | TSL 2 BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WNT4-201 | ENST00000290167 | 3845 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDR1-224 | ENST00000376567 | 3832 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRAMD1B-216 | ENST00000638157 | 3849 nt | TSL 5 BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNU13-201 | ENST00000215956 | 1630 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02210-CRHR1-202 | ENST00000634540 | 2695 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CATSPER1-201 | ENST00000312106 | 2619 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GAS7-219 | ENST00000585266 | 3535 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.99 | □□□□□ -0.33 | | |