Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPQQ9Y646 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms